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CCC-AXIS | Cuba

El eje CCC en la traslación del Mapeo Cerebral

Alan Evans, Pedro Valdes-Sosa, Dezhong Yao

El Mapeo Cerebral es un campo de las investigaciones del cerebro que hace énfasis en el uso de análisis computacional intensivo en datos de múltiples dominios (neuroimágenes, genética, clínicos/conductuales) para revelar los mecanismos subyacentes en desordenes cerebrales así como en el funcionamiento normal del cerebro. Bajo el auspicio de la Orgamización para el Mapeo Cerebral Humano (OHBM en inglés) este campo de investigación ha desarrollado un alcance global para la investigación básica. Sin embargo la traslación de estos resultados a la práctica clínica ha sido limitada. Líderes del Mapeo cerebral de tres países: China , Canada y Cuba , están ahora uniendo fuerzas para construir una red colaborativa que hará énfasis en las aplicaciones clínicas de la investigación del mapeo cerebral. El eje CCC se beneficiará de las fortalezas complementarias y aspectos comunes de los tres socios para forjar un marco computacional integrado para el uso compartido de datos y análisis conjunto de los datos de la investigación clínica, específicamente:

  • Todos: Experticidad científica y técnica en mapeo cerebral : cuidado universal de la salud
  • China (lidereada por Chengdu): grandes cohortes de pacientes
  • Canada (Montreal): infraestructura de IT de nivel mundial (CBRAIN/LORIS)
  • Cuba (La Habana): pesquisajes a nivel nacional y redes (LABMAN, Uludag et al., 2009)

El eje CCC estará mediado por la plataforma CBRAIN, desarrollada originalmente en la Universidad McGill en Canada, que proporciona servicios de cömputo a más de 400 grupos en 22 países en jumio 2016. CBRAIN permite el uso común de datos y su procesamiento usando recursos de cómputo de alto rendimiento (Sherif et al., 2014). CBRAIN está asociado también a LORIS, un sistema de bases de datos basado en web (Das et al., 2012,2015).

En este momento, existen acuerdos firmados entre Cuba, Mitchell Valdes (CNEURO, Habana, Cuba), China Dezhong Yao (UESTC, Chengdu, China) y Canada, Alan Evans (McGIll, Montreal, Canada). Por otro lado, en septiembre de 2016 fue firmado un acuerdo entre Cuba y Quebec en presencia del Premier de Quebec. Así mismo fue firmado en septiembre de 2016 un acuerdo marco para la cooperación estratégica entre el gobierno municipal de Chengdu y BIOCUBAFARMA para la creación del proyecto de mapeo cerebral conjunto CCC China-Canada-Cuba con al presencia del Premier chino Keqiang Le.

References

  1. Das S, Zijdenbos AP, Vins D, Harlap J, Evans AC (2012) LORIS: A web-based data management system for multi-center studies Front Neuroinf 5:37
  2. Sherif T, Rioux P, Rousseau M-E,..., Das S, Evans AC (2014) CBRAIN: A web-based, distributed computing platform for collaborative neuroimaging research Front Neurosci 8: 54
  3. Das S, Glatard T,.., Evans AC (2015) The MNI data-sharing and processing ecosystem Neuroimage (in press, PMID: 26364860)
  4. Uludağ K, Evans AC,., Valdés-Sosa P (2009) Latin American Brain Mapping Network (LABMAN) Neuroimage 47(1):312-316

CCC-Axis | China

CCC轴线在转化 脑成像 科学计划 中的

Alan Evans, Pedro Valdes-Sosa, 尧德中

脑成像是大脑研究的一个重要领域，该领域强调运用高性能计算分析多模态数据（神经成像，遗传学以及临床行为学）来揭示大脑紊乱和正常功能的潜在机理。在人类脑图谱组织（OHBM）的支持下，该领域已经成为覆盖全球的基础性研究。然而，基础研究向临床应用的转化是有限的。为了更好地促进学术成果转化，来自中国，加拿大和古巴三个国家脑成像的专家现在正积极推进建立一个协作网络叫做CCC轴线，该网络旨在对脑成像研究成果进行科学有效地临床转化。CCC轴线将整合三个成员国的优势构建高性能计算新平台，其主要用于数据共享和临床研究大数据的综合分析，特别地：

  • 愿景：联合发展脑成像的科学与技术，促进人类健康事业
  • 中国（成都）：医疗大数据
  • 加拿大（蒙特利尔） 加拿大（蒙特利尔） 加拿大（蒙特利尔） 加拿大（蒙特利尔） ：国际一流 现代 信息技术 信息技术 (CBRAIN/LORIS)
  • 古巴（ 古巴（ 古巴（ 首都 哈瓦那）： 哈瓦那）： 哈瓦那）： 国家 卫生调控 ，拉丁美洲协作 拉丁美洲协作 网络（ 网络（ LABMAN，Uludag et al., 2009）

CCC轴线成员国依托CBRAIN平台，该平台最早起始于加拿大的麦吉尔大学，截止到2016年6月已给22个国家的400多个研究团队提供云计算服务。CBRAIN采用高性能计算平台对数据进行共享和分析处理（Sherif et al.,2014）。CBRAIN还与网络可视化的多模态数据库系统（LORIS）进行协同交互（Das et al.,2012,2015）。

来自古巴的Mitchell Valdes 教授(古巴神经科学中心, 哈瓦那, 古巴)，中国的尧德中教授（中国电子科技大学）以及加拿大的Alan Evans（麦吉尔大学, 加拿大）签署了CCC轴线合作协议。此前，在2016年9月，古巴政府和魁北克省在魁北克省长的见证下签署了合作协议。同时成都市人民政府和古巴生物医药集团在中国总理李克强的见证下也签署了战略合作框架协议，该协议旨在建立中国-加拿大-古巴（CCC）脑成像科学计划。

References

  1. Das S, Zijdenbos AP, Vins D, Harlap J, Evans AC (2012) LORIS: A web-based data management system for multi-center studies Front Neuroinf 5:37
  2. Sherif T, Rioux P, Rousseau M-E,..., Das S, Evans AC (2014) CBRAIN: A web-based, distributed computing platform for collaborative neuroimaging research Front Neurosci 8: 54
  3. Das S, Glatard T,.., Evans AC (2015) The MNI data-sharing and processing ecosystem Neuroimage (in press, PMID: 26364860)
  4. Uludağ K, Evans AC,., Valdés-Sosa P (2009) Latin American Brain Mapping Network (LABMAN) Neuroimage 47(1):312-316

CCC-Axis
Canada | English

The CCC-Axis in Translational Brain Mapping

Alan Evans (Montreal), Pedro Valdes-Sosa (Havana), Dezhong Yao (Chengdu)

Brain mapping is a field of brain research that emphasizes the use of compute-intensive analysis of multi-domain (neuroimaging, genetics and clinical/behavioural) data to reveal the mechanisms underlying brain disorders and normal brain function. Under the auspices of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM), the field has developed a global reach for basic research. However, the translation of this research into the clinic has been limited. Brain mapping leaders from three countries, China, Canada and Cuba, are now joining forces to build a collaborative network that will emphasize the clinical applications of brain mapping research. The CCC-Axis takes advantage of complementary strengths and commonalities from the three partners to forge an integrated computational framework for data-sharing and joint analysis of clinical research data, specifically:

  • All: Scientific and technical expertise in brain mapping ; universal health care
  • China (lead by Chengdu): Very large patient cohorts
  • Canada (Montreal): world-leading IT infrastructure (CBRAIN/LORIS)
  • Cuba (Havana): National screening, networking (LABMAN, Uludag et al., 2009)

The CCC-Axis will be mediated by the CBRAIN platform, originally developed at McGill University in Canada, that provides compute services to over 400 groups in 22 countries as of June, 2016. CBRAIN allows for data to be shared and processed using high-performance computing resources (Sherif et al., 2014). CBRAIN is associated by a web-based, multi-domain databasing system, LORIS (Das et al., 2012,2015).

In this moment, there are agreements signed between Cuba (Mitchell Valdes, CNEURO, Habana), China (Dezhong Yao, UESTC, Chengdu) and Canada (Alan Evans, McGill, Montreal). In September 2016, an agreement for greater economic and scientific engagement between Cuba and Quebec was signed by the Premier of Quebec, Philippe Couillard. Also in September 2016, in the presence of Chinese Premier Keqiang Le, a strategic cooperation agreement was signed between the Chengdu municipal people’s government and BIOCUBAFARMA for the launch of the China-Canada-Cuba (CCC) Brain Mapping Project.

References

  1. Das S, Zijdenbos AP, Vins D, Harlap J, Evans AC (2012) LORIS: A web-based data management system for multi-center studies Front Neuroinf 5:37
  2. Sherif T, Rioux P, Rousseau M-E,..., Das S, Evans AC (2014) CBRAIN: A web-based, distributed computing platform for collaborative neuroimaging research Front Neurosci 8: 54
  3. Das S, Glatard T,.., Evans AC (2015) The MNI data-sharing and processing ecosystem Neuroimage (in press, PMID: 26364860)
  4. Uludağ K, Evans AC,., Valdés-Sosa P (2009) Latin American Brain Mapping Network (LABMAN) Neuroimage 47(1):312-316

L’axe CCC
Canada | Français

L’axe CCC dans la cartographie translationnelle du cerveau

Alan Evans (Montreal), Pedro Valdes-Sosa (La Havane), Dezhong Yao (Chengdu)

La cartographie cérébrale est un champ de recherche sur le cerveau qui met l’accent sur l’analyse à calcul intensif de données émanants de multiples domaines (neuroimagerie, génétique et clinique/comportementale) dans le but de dévoiler les mécanismes qui sous-tendent les maladies neurologiques ainsi que le fonctionnement normal du cerveau. Sous la conduite de l’OHBM (Organization for Human Brain Mapping, un regroupement de scientifiques pour la cartographie du cerveau humain), le domaine a acquis une portée à l’échelle mondiale quant à la recherche fondamentale. Cependant, la transposition des résultats de cette recherche en pratique clinique est encore limitée. Aujourd’hui, des chefs de file en cartographie cérébrale provenant de trois pays, la Chine, le Canada et Cuba, s’allient pour établir un réseau collaboratif centré sur les applications cliniques de la recherche. L’axe CCC exploite à la fois les forces complémentaires et communes des trois partenaires afin de mettre en place un cadre computationnel intégré pour le partage et l’analyse conjointe de données de recherche clinique, plus précisément:

  • Tous: expertise scientifique et technique dans la cartographie du cerveau; soin de santé universel
  • Chine (dirigée par Chengdu): très grandes cohortes de patients
  • Canada (Montréal): une infrastructure informatique de premier plan (CBRAIN / LORIS)
  • Cuba (La Havane): projection nationale, réseautage (LABMAN, Uludag et al., 2009)

L’axe CCC s’appuiera sur la plateforme CBRAIN (The Canadian Brain Imaging Research Platform), conçue à l’Université McGill au Canada. En juin 2016, la plateforme fournissait des services de calcul intensif à plus de 400 groupes en 22 pays. CBRAIN permet de partager et traiter des données en faisant appel à des ressources de calcul de haute-performance (Sherif et al., 2014). CBRAIN s’intègre au système de gestion de bases de données multidisciplinaires en ligne, LORIS (Das et al., 2012,2015).

Actuellement, il y a des conventions signées entre Cuba (Mitchell Valdes, CNEURO, La Havane), la Chine (Dezhong Yao, UESTC, Chengdu) et le Canada (Alan Evans, McGill, Montréal). En septembre 2016, un protocole d’entente en vue d’accroître l’engagement économique et scientifique entre Cuba et le Québec a été signé par le premier ministre du Québec, Philippe Couillard. Également en septembre 2016, en présence du premier ministre chinois Keqiang Le, un accord de coopération stratégique a été conclu entre le Gouvernement populaire municipal de Chengdu et l’entreprise biopharmaceutique BIOCUBAFARMA pour le lancement du projet de recherche en cartographie cérébrale, le « China-Canada-Cuba (CCC) Brain Mapping Project ».

References

  1. Das S, Zijdenbos AP, Vins D, Harlap J, Evans AC (2012) LORIS: A web-based data management system for multi-center studies Front Neuroinf 5:37
  2. Sherif T, Rioux P, Rousseau M-E,..., Das S, Evans AC (2014) CBRAIN: A web-based, distributed computing platform for collaborative neuroimaging research Front Neurosci 8: 54
  3. Das S, Glatard T,.., Evans AC (2015) The MNI data-sharing and processing ecosystem Neuroimage (in press, PMID: 26364860)
  4. Uludağ K, Evans AC,., Valdés-Sosa P (2009) Latin American Brain Mapping Network (LABMAN) Neuroimage 47(1):312-316